Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir881-201ENSMUST00000104844 78 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24278-201ENSMUST00000104239 127 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23821-201ENSMUST00000158738 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24218-201ENSMUST00000180163 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 mt-Ti-201ENSMUST00000082393 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22744-201ENSMUST00000083444 65 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22077-201ENSMUST00000157594 93 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 AC165157.3-201ENSMUST00000220815 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mirlet7g-201ENSMUST00000083506 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Traf3ip1Q149C2 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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