Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm22732-201ENSMUST00000158093 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24199-201ENSMUST00000157808 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm25322-201ENSMUST00000122556 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm25798-201ENSMUST00000082641 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Hoxd9P28357 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir20b-201ENSMUST00000102087 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm43038-201ENSMUST00000202359 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25014-201ENSMUST00000158401 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxd9P28357 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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