Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm26290-201ENSMUST00000158891 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 AC160976.1-201ENSMUST00000215092 148 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm26062-201ENSMUST00000083379 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 AC158537.2-201ENSMUST00000223575 150 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Hoxb1P17919 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24399-201ENSMUST00000157869 74 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm23306-201ENSMUST00000179058 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm26499-201ENSMUST00000178544 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm26096-201ENSMUST00000179084 79 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28398-201ENSMUST00000186587 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm29653-201ENSMUST00000187192 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28810-201ENSMUST00000188173 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28575-201ENSMUST00000188234 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28132-201ENSMUST00000189901 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm29580-201ENSMUST00000189921 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28858-201ENSMUST00000190517 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28210-201ENSMUST00000190631 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm28336-201ENSMUST00000190743 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm29042-201ENSMUST00000191564 166 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Hoxb1P17919 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms