Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Mir669j-201ENSMUST00000179023 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn4O35054 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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