Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir344h-2-201ENSMUST00000175612 60 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm42845-201ENSMUST00000197766 105 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm23442-201ENSMUST00000082919 134 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm26712-201ENSMUST00000180813 217 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 AL845349.1-201ENSMUST00000213794 78 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Mir148a-201ENSMUST00000083571 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Mir363-201ENSMUST00000093598 75 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24884-201ENSMUST00000158784 119 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm44327-201ENSMUST00000200068 117 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm22838-201ENSMUST00000158437 99 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24843-201ENSMUST00000158682 76 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
Ccdc171E9Q1U1 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Mir378c-201ENSMUST00000184478 99 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm37998-201ENSMUST00000195699 166 ntTSL 5 BASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Ccdc171E9Q1U1 Gm25160-201ENSMUST00000158914 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156 ms