Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 CT571266.1-201ENSMUST00000222859 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm43206-201ENSMUST00000197990 114 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22770-201ENSMUST00000158368 67 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Snord50a-201ENSMUST00000178154 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm24463-201ENSMUST00000178417 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm23790-201ENSMUST00000083013 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Mir21c-201ENSMUST00000184910 78 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Chmp3Q9CQ10 Olfr1448-203ENSMUST00000213713 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
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Chmp3Q9CQ10 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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Chmp3Q9CQ10 Gm22129-201ENSMUST00000179034 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm26466-201ENSMUST00000179615 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Chmp3Q9CQ10 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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