Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm6003-201ENSMUST00000187903 463 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Traf3ip1Q149C2 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC154213.2-201ENSMUST00000227138 187 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 n-R5s18-201ENSMUST00000122740 121 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir200a-201ENSMUST00000083466 90 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.18□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir6390-201ENSMUST00000184405 129 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
Traf3ip1Q149C2 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25633-201ENSMUST00000178565 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir382-201ENSMUST00000083494 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm44457-201ENSMUST00000198109 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Traf3ip1Q149C2 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.7 ms