Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm22802-201ENSMUST00000175621 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 n-R5s157-201ENSMUST00000122543 121 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Sh3bp1P55194 Gm23578-201ENSMUST00000103943 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24020-201ENSMUST00000180156 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Sh3bp1P55194 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
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