Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PtpreP49446 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Traj49-202ENSMUST00000199452 62 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24162-201ENSMUST00000093665 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm15654-201ENSMUST00000152660 300 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PtpreP49446 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23376-201ENSMUST00000082938 160 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm24384-201ENSMUST00000122693 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25899-201ENSMUST00000082672 141 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25705-201ENSMUST00000083119 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm26398-201ENSMUST00000179015 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PtpreP49446 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1547.4 ms