Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25497-201ENSMUST00000104425 132 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm25473-201ENSMUST00000180191 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ggta1P23336 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
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Ggta1P23336 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ggta1P23336 Gm22030-201ENSMUST00000116942 63 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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