Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn4O35054 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Traj30-201ENSMUST00000103711 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Mir7663-201ENSMUST00000183950 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn4O35054 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn4O35054 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
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