Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
H2-Q1O19441 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm23864-201ENSMUST00000177607 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm24374-201ENSMUST00000104394 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC1□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC1□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Mir22-201ENSMUST00000083595 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
H2-Q1O19441 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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H2-Q1O19441 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
H2-Q1O19441 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
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