Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25759-201ENSMUST00000103988 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23114-201ENSMUST00000158478 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir3094-201ENSMUST00000175121 64 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm27446-201ENSMUST00000183963 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25495-201ENSMUST00000104431 131 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm44396-201ENSMUST00000199843 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm45492-201ENSMUST00000211611 288 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1154-203ENSMUST00000215862 2624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23339-201ENSMUST00000158962 139 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Mir344d-3-201ENSMUST00000175458 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22233-201ENSMUST00000157464 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25868-201ENSMUST00000158253 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23048-201ENSMUST00000157237 129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm44734-201ENSMUST00000206025 237 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Cldn34c2J3QNM1 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm25610-201ENSMUST00000104016 129 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Cldn34c2J3QNM1 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.3 ms