Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Mir30f-201ENSMUST00000196073 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm25619-201ENSMUST00000122621 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Mir1969-201ENSMUST00000157623 94 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm43907-201ENSMUST00000203128 117 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22402-201ENSMUST00000174920 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
ApobE9Q414 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Mir2136-201ENSMUST00000158781 75 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm22464-201ENSMUST00000175273 64 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm25023-201ENSMUST00000082977 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23570-201ENSMUST00000083029 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm37832-201ENSMUST00000118935 189 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm27366-201ENSMUST00000184967 108 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23291-201ENSMUST00000175611 78 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm24223-201ENSMUST00000158827 90 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-1.71□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
ApobE9Q414 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.69
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