Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm44803-201ENSMUST00000204384 156 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22324-201ENSMUST00000158903 114 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm24009-201ENSMUST00000157734 93 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 AC159093.2-201ENSMUST00000227881 297 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Mir1899-201ENSMUST00000122798 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm10548-202ENSMUST00000165672 272 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.54□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Scarna9-201ENSMUST00000104318 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Polr2k-ps-201ENSMUST00000120170 175 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Snord60-201ENSMUST00000082834 78 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23881-201ENSMUST00000116872 66 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23857-201ENSMUST00000158379 111 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Mir3473d-201ENSMUST00000175346 81 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 AC154506.4-201ENSMUST00000224898 3416 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm25693-201ENSMUST00000175443 85 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0.6□□□□□ -2.5
Ccdc171E9Q1U1 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 1700127F24Rik-202ENSMUST00000223214 259 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir344-2-201ENSMUST00000175446 80 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir6369-201ENSMUST00000183772 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm26081-201ENSMUST00000104068 132 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Mir145a-201ENSMUST00000083658 70 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Ccdc171E9Q1U1 Gm24290-201ENSMUST00000157634 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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