Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm25370-201ENSMUST00000158159 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Mir5619-201ENSMUST00000176065 61 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Limd1Q9QXD8 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25329-201ENSMUST00000158041 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm24801-201ENSMUST00000178503 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir466l-201ENSMUST00000104866 121 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm25449-201ENSMUST00000179389 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Limd1Q9QXD8 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Limd1Q9QXD8 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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