Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm26426-201ENSMUST00000177866 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm26060-201ENSMUST00000180094 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Tspan4Q9DCK3 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23763-201ENSMUST00000158345 60 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Zfp981-203ENSMUST00000179175 2953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir3079-201ENSMUST00000175428 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Tspan4Q9DCK3 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm37586-201ENSMUST00000193654 204 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.82□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Tspan4Q9DCK3 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.2 ms