Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm23817-201ENSMUST00000158449 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Defb38-201ENSMUST00000066416 286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm23652-201ENSMUST00000116752 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm26104-201ENSMUST00000157250 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm24238-201ENSMUST00000157792 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm25887-201ENSMUST00000157777 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Mir3083-201ENSMUST00000175377 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm25289-201ENSMUST00000122799 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm24649-201ENSMUST00000157106 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Traj61-201ENSMUST00000165025 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Zfp969-202ENSMUST00000131041 252 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm24099-201ENSMUST00000083384 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Chmp3Q9CQ10 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Chmp3Q9CQ10 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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