Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22790-201ENSMUST00000157229 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm23277-201ENSMUST00000157914 136 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir5104-201ENSMUST00000175319 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir544-201ENSMUST00000103813 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Selenok-ps4-201ENSMUST00000178835 277 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm23714-201ENSMUST00000179259 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22403-201ENSMUST00000174919 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir3061-201ENSMUST00000175129 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm12869-201ENSMUST00000156265 344 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm27326-201ENSMUST00000183504 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm23567-201ENSMUST00000178005 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm24523-201ENSMUST00000083965 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm20734-201ENSMUST00000216939 193 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir8119-201ENSMUST00000183371 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm27934-201ENSMUST00000158795 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir7665-201ENSMUST00000184907 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 AC153950.1-201ENSMUST00000219916 3238 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Sh3bp1P55194 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms