Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm42795-201ENSMUST00000198847 76 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm25740-201ENSMUST00000180247 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm24988-201ENSMUST00000104460 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Hoxd9P28357 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir764-201ENSMUST00000103259 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm16550-201ENSMUST00000162550 126 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir5117-201ENSMUST00000083226 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm22551-201ENSMUST00000157795 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Hoxd9P28357 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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