Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm25307-201ENSMUST00000158885 106 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ggta1P23336 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Mir3470a-201ENSMUST00000175223 77 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22327-201ENSMUST00000158899 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22757-201ENSMUST00000102279 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Snord91a-201ENSMUST00000104305 93 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
Ggta1P23336 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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Ggta1P23336 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir191-201ENSMUST00000196210 74 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Olfr778-ps1-201ENSMUST00000204517 207 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm25006-201ENSMUST00000083813 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ggta1P23336 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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