Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24250-201ENSMUST00000157320 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22164-201ENSMUST00000158413 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23770-201ENSMUST00000178009 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22832-201ENSMUST00000178022 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23863-201ENSMUST00000178265 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24828-201ENSMUST00000178507 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23052-201ENSMUST00000178633 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25729-201ENSMUST00000179050 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25359-201ENSMUST00000179315 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22624-201ENSMUST00000179913 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm31450-201ENSMUST00000220668 132 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir148b-201ENSMUST00000083626 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22785-201ENSMUST00000104087 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm16539-201ENSMUST00000160086 327 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm26123-201ENSMUST00000083363 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir6928-201ENSMUST00000185166 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22332-201ENSMUST00000158072 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24461-201ENSMUST00000082735 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24588-201ENSMUST00000116696 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22966-201ENSMUST00000157957 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Cldn34c2J3QNM1 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.9 ms