Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 CT009723.2-201ENSMUST00000215702 124 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Snora19-201ENSMUST00000082962 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23658-201ENSMUST00000083233 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm25149-201ENSMUST00000157119 82 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm22814-201ENSMUST00000157452 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm29047-201ENSMUST00000189816 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm45617-201ENSMUST00000211132 209 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm44328-201ENSMUST00000199331 75 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm22087-201ENSMUST00000158339 88 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm26210-201ENSMUST00000158680 91 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Snora75-201ENSMUST00000082903 133 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Mir18-201ENSMUST00000083469 96 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC-0.43□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm28767-201ENSMUST00000188601 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Mir327-201ENSMUST00000199328 69 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
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Ccdc171E9Q1U1 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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Ccdc171E9Q1U1 Gm24796-201ENSMUST00000104007 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm25611-201ENSMUST00000104017 133 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.46□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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Ccdc171E9Q1U1 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
Ccdc171E9Q1U1 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 B230307C23Rik-201ENSMUST00000113729 192 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm15213-201ENSMUST00000122098 216 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm26158-201ENSMUST00000158973 119 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm17677-201ENSMUST00000166746 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm23917-201ENSMUST00000175256 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm29535-201ENSMUST00000185723 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm28143-201ENSMUST00000191082 109 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm23482-201ENSMUST00000104172 122 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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