Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm24851-201ENSMUST00000158028 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm22638-201ENSMUST00000179674 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Mir8103-201ENSMUST00000183945 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Chmp3Q9CQ10 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Chmp3Q9CQ10 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Gm26341-201ENSMUST00000104561 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Mir467a-7-201ENSMUST00000178635 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Mir467a-10-201ENSMUST00000179320 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Mir467a-9-201ENSMUST00000179752 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Snord78-201ENSMUST00000104032 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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Chmp3Q9CQ10 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Chmp3Q9CQ10 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm25119-201ENSMUST00000158815 88 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm22251-201ENSMUST00000083216 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Chmp3Q9CQ10 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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