Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm24261-201ENSMUST00000083744 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24177-201ENSMUST00000158927 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23138-201ENSMUST00000083365 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23253-201ENSMUST00000157441 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Gm23509-201ENSMUST00000083080 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Pggt1bQ8BUY9 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Pggt1bQ8BUY9 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms