Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Mir7079-201ENSMUST00000184697 69 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44462-201ENSMUST00000199696 129 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25793-201ENSMUST00000083287 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26116-201ENSMUST00000175600 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Mir6377-201ENSMUST00000183760 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44977-201ENSMUST00000205283 420 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25110-201ENSMUST00000116684 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25775-201ENSMUST00000116716 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm24795-201ENSMUST00000116737 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25171-201ENSMUST00000116926 121 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm24963-201ENSMUST00000157916 144 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 AC141438.3-201ENSMUST00000215632 202 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Cpne9Q1RLL3 4930522L14Rik-202ENSMUST00000112547 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm22469-201ENSMUST00000104118 133 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25024-201ENSMUST00000179667 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 AC153930.1-201ENSMUST00000220016 358 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm14946-201ENSMUST00000119859 296 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23375-201ENSMUST00000175407 83 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm6985-201ENSMUST00000121255 271 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Fam46d-201ENSMUST00000101292 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
Cpne9Q1RLL3 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms