Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm27975-201ENSMUST00000184400 101 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Mir1a-1-201ENSMUST00000093635 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Nlrp9c-202ENSMUST00000085944 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Sh3bp2Q06649 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Snora20-201ENSMUST00000082703 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Ctdspl2-202ENSMUST00000110572 4160 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm11248-201ENSMUST00000119568 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Vmn1r28-201ENSMUST00000226813 10877 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25854-201ENSMUST00000082792 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25542-201ENSMUST00000116889 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm44807-201ENSMUST00000206115 154 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm24495-201ENSMUST00000178575 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm22253-201ENSMUST00000179870 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Sh3bp2Q06649 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Sh3bp2Q06649 Gm24183-201ENSMUST00000122572 93 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Sh3bp2Q06649 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm22140-201ENSMUST00000158745 120 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm42935-201ENSMUST00000202004 151 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm27686-201ENSMUST00000185123 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm43379-201ENSMUST00000196253 7726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Sh3bp2Q06649 Gm22205-201ENSMUST00000122655 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms