Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Vmn1r75-207ENSMUST00000228646 4466 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm13246-201ENSMUST00000120994 315 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm23419-201ENSMUST00000175523 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm27928-201ENSMUST00000183747 256 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25038-201ENSMUST00000082928 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm26415-201ENSMUST00000157673 292 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm15069-201ENSMUST00000117792 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm11856-201ENSMUST00000118712 276 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm15068-201ENSMUST00000119796 192 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm24559-201ENSMUST00000157519 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
Sh3bp1P55194 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Igkv13-54-1-201ENSMUST00000196495 303 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25958-201ENSMUST00000175114 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23558-201ENSMUST00000157823 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm27672-201ENSMUST00000183751 204 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Mir297a-2-201ENSMUST00000103795 90 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm14567-201ENSMUST00000117155 174 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm20391-201ENSMUST00000174722 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Sh3bp1P55194 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Sh3bp1P55194 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms