Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir490-201ENSMUST00000093567 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm14626-201ENSMUST00000117619 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm22828-201ENSMUST00000083768 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Nedd9O35177 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm27792-201ENSMUST00000184031 115 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25636-201ENSMUST00000082666 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr1007-ps1-201ENSMUST00000217468 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22743-201ENSMUST00000083445 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm44489-201ENSMUST00000104619 97 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm21885-201ENSMUST00000178891 327 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
Nedd9O35177 AC133934.2-201ENSMUST00000221729 4129 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 8030445P17Rik-201ENSMUST00000192614 2741 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Olfr790-203ENSMUST00000215067 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm14568-201ENSMUST00000119321 294 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm22556-201ENSMUST00000157803 100 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Nedd9O35177 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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