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Protein–RNA interactions for Protein: O35054
Cldn4, Claudin-4, mouse
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (Experimental data)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
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Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
Cldn4
O35054
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□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
AC165138.1-201
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270 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm16976-205
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226 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Mir490-201
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84 nt
BASIC
1.47
□□□□□ -2.17
Cldn4
O35054
Gm25992-201
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BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm26018-201
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BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
1.46
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm22306-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Olfr1431-202
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm22545-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Snord100-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm13922-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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TSL 2
BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm27517-201
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BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm28409-201
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BASIC
1.45
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
n-R5s188-201
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BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm26415-201
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292 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23080-201
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103 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23760-201
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BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23337-201
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BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm17364-201
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TSL 5
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm27672-201
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BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm29603-201
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334 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
AC126939.3-201
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BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23678-201
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107 nt
BASIC
1.44
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Olfr1002-202
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TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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2793 nt
APPRIS P1
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm15068-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm24559-201
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BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23996-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm21905-201
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.43
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Cr2-206
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206 nt
TSL 1 (best)
BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Igkv13-54-1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm43602-201
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300 nt
BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Snord13-201
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BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm24054-201
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BASIC
1.42
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
AC168880.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm23772-201
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Zfp969-202
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252 nt
TSL 2
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm25558-201
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106 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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274 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm24366-201
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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77 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Gm42988-201
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BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Mir6962-201
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
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107 nt
BASIC
1.41
□□□□□ -2.18
Cldn4
O35054
Mir343-201
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm24263-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm25878-201
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm14567-201
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174 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm27934-201
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm25936-201
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm18502-201
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199 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
AL627387.1-201
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BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Mir201-201
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66 nt
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Olfr141-201
ENSMUST00000216117
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APPRIS P1
TSL 5
BASIC
1.4
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Pcdh11x-208
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5394 nt
APPRIS ALT2
TSL 5
BASIC
1.39
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Gm24345-201
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124 nt
BASIC
1.39
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Mir3471-1-201
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BASIC
1.39
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Olfr1319-ps1-201
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BASIC
1.39
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
1.38
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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114 nt
BASIC
1.38
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
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□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
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Cldn4
O35054
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BASIC
1.38
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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127 nt
BASIC
1.38
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
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BASIC
1.38
□□□□□ -2.19
Cldn4
O35054
Snord14a-201
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BASIC
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1.38
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Cldn4
O35054
Gm22738-201
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147 nt
BASIC
1.38
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