Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 AC136457.1-201ENSMUST00000224195 156 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm23996-201ENSMUST00000158062 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir7050-201ENSMUST00000184636 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir411-201ENSMUST00000083543 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm18795-202ENSMUST00000223373 2920 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24082-201ENSMUST00000175175 83 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm2056J3QQ02 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm24913-201ENSMUST00000157286 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 AC126691.1-201ENSMUST00000226534 202 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Traj21-201ENSMUST00000103720 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 AC124687.1-201ENSMUST00000221868 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 CT033781.2-201ENSMUST00000221113 153 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm10730-201ENSMUST00000194097 2723 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Gm2056J3QQ02 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm28270-201ENSMUST00000188550 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm28328-201ENSMUST00000188869 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Mir92-1-201ENSMUST00000102108 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Gm2056J3QQ02 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms