Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm23678-201ENSMUST00000083157 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm26038-201ENSMUST00000158151 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Olfr730-202ENSMUST00000205837 4903 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm26090-201ENSMUST00000157897 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25364-201ENSMUST00000158851 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm26420-201ENSMUST00000104273 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm23106-201ENSMUST00000157554 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Snord1a-201ENSMUST00000083160 74 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir9-2-201ENSMUST00000083490 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm25663-201ENSMUST00000157698 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm43381-201ENSMUST00000198553 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm10172-201ENSMUST00000085929 558 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 BC022960-201ENSMUST00000119987 1815 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22761-201ENSMUST00000102278 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm26076-201ENSMUST00000104065 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Mir92-2-201ENSMUST00000083679 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn34c2J3QNM1 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22079-201ENSMUST00000157592 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23859-201ENSMUST00000158383 64 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm25769-201ENSMUST00000158569 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm24494-201ENSMUST00000083804 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Olfr618-202ENSMUST00000214883 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1225-203ENSMUST00000217054 5517 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Cldn34c2J3QNM1 Snord90-201ENSMUST00000104568 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.8 ms