Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

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Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm22183-201ENSMUST00000175420 73 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm42773-201ENSMUST00000196962 148 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23166-201ENSMUST00000157164 101 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
ApobE9Q414 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 AC129085.1-201ENSMUST00000225263 165 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm24806-201ENSMUST00000117036 90 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm23535-201ENSMUST00000157542 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Traj9-201ENSMUST00000103731 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.44□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Mir547-201ENSMUST00000102051 78 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm22999-201ENSMUST00000157082 88 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Mir216b-201ENSMUST00000102363 86 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Cyp2j7-ps1-201ENSMUST00000122430 173 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm22335-201ENSMUST00000157724 99 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm43927-201ENSMUST00000204599 117 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Mir6957-201ENSMUST00000183708 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm45544-201ENSMUST00000211130 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ApobE9Q414 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm24051-201ENSMUST00000158622 75 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 mt-Tc-201ENSMUST00000082400 66 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm22815-201ENSMUST00000157451 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm22788-201ENSMUST00000157876 61 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Platr25-208ENSMUST00000222602 939 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ApobE9Q414 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
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