Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm22753-201ENSMUST00000083657 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm27943-201ENSMUST00000184844 116 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 AC145736.2-201ENSMUST00000216305 365 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24171-201ENSMUST00000104126 131 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24467-201ENSMUST00000157887 126 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24728-201ENSMUST00000158226 125 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25241-201ENSMUST00000174909 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm26217-201ENSMUST00000175212 84 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm8508-201ENSMUST00000061226 363 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm22048-201ENSMUST00000104721 89 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1485-ps1-201ENSMUST00000208420 370 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Snord85-201ENSMUST00000083262 73 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm24509-201ENSMUST00000157086 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25358-201ENSMUST00000157189 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Mir3105-201ENSMUST00000175480 85 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps1-201ENSMUST00000184001 403 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Ccdc171E9Q1U1 Gm25408-201ENSMUST00000104104 133 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm24393-201ENSMUST00000158135 97 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm37330-201ENSMUST00000192606 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm22813-201ENSMUST00000199948 123 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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Ccdc171E9Q1U1 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
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Ccdc171E9Q1U1 Mir532-201ENSMUST00000093630 96 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
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Ccdc171E9Q1U1 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Trgj2-201ENSMUST00000197113 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm45197-201ENSMUST00000205288 151 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Ccdc171E9Q1U1 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
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Ccdc171E9Q1U1 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm11834-201ENSMUST00000122257 585 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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Ccdc171E9Q1U1 Gm25338-201ENSMUST00000116849 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm22962-201ENSMUST00000157962 73 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm23918-201ENSMUST00000175253 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm27993-201ENSMUST00000184362 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms