Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrit3W8DXL4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrit3W8DXL4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms