Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vstm4T1NXB5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vstm4T1NXB5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms