Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Homer1Q9Z2Y3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Homer1Q9Z2Y3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms