Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubl3Q9Z2M6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubl3Q9Z2M6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms