Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Crlf3Q9Z2L7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crlf3Q9Z2L7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms