Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd4Q9Z2D7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd4Q9Z2D7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms