Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Thbs4Q9Z1T2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Thbs4Q9Z1T2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms