Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms