Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VarsQ9Z1Q9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VarsQ9Z1Q9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms