Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q5

Clic1, Chloride intracellular channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic1Q9Z1Q5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clic1Q9Z1Q5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clic1Q9Z1Q5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms