Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NfkbiaQ9Z1E3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms