Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z183

Padi4, Protein-arginine deiminase type-4, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi4Q9Z183 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Padi4Q9Z183 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Padi4Q9Z183 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms