Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Shcbp1Q9Z179 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms