Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cpne6Q9Z140 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne6Q9Z140 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms