Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl8Q9Z121 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccl8Q9Z121 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ccl8Q9Z121 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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Ccl8Q9Z121 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl8Q9Z121 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms