Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hmg20bQ9Z104 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hmg20bQ9Z104 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms